Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClockO08785 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClockO08785 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClockO08785 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClockO08785 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClockO08785 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClockO08785 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ClockO08785 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClockO08785 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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