Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC117090L7N257 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BC117090L7N257 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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