Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Gm21887J3QQ04 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms