Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim18J3QNP2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim18J3QNP2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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