Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20830J3KML6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20830J3KML6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms