Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20828J3KMI7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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