Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sptbn5F6UCX4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sptbn5F6UCX4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms