Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf4E9QAP7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf4E9QAP7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms