Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms