Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FancfE9Q5Z5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FancfE9Q5Z5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms