Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Zfp558E9Q1J0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp558E9Q1J0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp558E9Q1J0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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