Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt78E9Q0F0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt78E9Q0F0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms