Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms