Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms