Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc13D3YV10 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc13D3YV10 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms