Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cttnbp2B9EJA2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms