Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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