Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms