Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3173A6NAS3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms