Protein–RNA interactions for Protein: A2AIL4

Ndufaf6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf6A2AIL4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf6A2AIL4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufaf6A2AIL4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms