Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700023F06RikA2AB62 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms