Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrdcA0A0G2JEU3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrdcA0A0G2JEU3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrdcA0A0G2JEU3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrdcA0A0G2JEU3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrdcA0A0G2JEU3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrdcA0A0G2JEU3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrdcA0A0G2JEU3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrdcA0A0G2JEU3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrdcA0A0G2JEU3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms