Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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