Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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