Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms