Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms