Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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