Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB6CQ53S08 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms