Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRRQ15256 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRRQ15256 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms