Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms