Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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LINC00587B1AMM8 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LINC00587B1AMM8 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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