Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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GTF3C6Q969F1 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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GTF3C6Q969F1 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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GTF3C6Q969F1 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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GTF3C6Q969F1 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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GTF3C6Q969F1 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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