Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCDC38Q502W7 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms