Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CA9Q16790 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CA9Q16790 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CA9Q16790 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CA9Q16790 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CA9Q16790 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CA9Q16790 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CA9Q16790 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CA9Q16790 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CA9Q16790 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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