Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1AQ15573 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms