Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms