Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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NME3Q13232 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NME3Q13232 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NME3Q13232 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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