Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TTPAP49638 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TTPAP49638 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TTPAP49638 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TTPAP49638 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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