Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms