Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNMO15061 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNMO15061 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNMO15061 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms