Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VSTM1Q6UX27 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms