Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms