Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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