Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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