Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXA13P31271 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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HOXA13P31271 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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HOXA13P31271 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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HOXA13P31271 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXA13P31271 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXA13P31271 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXA13P31271 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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HOXA13P31271 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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