Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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