Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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RNF7Q9UBF6 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RNF7Q9UBF6 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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RNF7Q9UBF6 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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RNF7Q9UBF6 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF7Q9UBF6 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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