Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 FRMPD4-202ENST00000616992 7916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMA3Q16787 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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