Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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ITGA9Q13797 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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ITGA9Q13797 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ITGA9Q13797 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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