Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms